Zu den im Museum präsentierten Ausstellungsthemen gehören u.a.:
- die Baugeschichte des Münsters und des Klosters
- die Dichtungen des Mönchs Walahrid Strabo
- der auf der Reichenau entstandene St. Galler Klosterplan
- das Wirken des wissenschaftlich tätigen Mönchs Hermann des Lahmen
- die Reliquienverehrung und die einzigartige Reichenauer Buchmalerei.
Situationsbedingt sind Änderungen bezüglich der Strecke und der Sehenswürdigkeiten möglich.